A Magyar Virtuális Enciklopédia az Informatikai és Hírközlési Minisztérium kezdeményezésére és szponzorálásával indult, az IHM és a Magyar Tu­dományos Akadémia együttműködése keretében, az MTA Filozófiai Ku­ta­tó­intézete koordinálásában, »A 21. század tudományrendszere« című nagy­projekt részeként. 2003 októbere és 2005 augusztusa között mintegy 1500 címdokumentum készült el.

A tartalmak bővítése 2005 decemberében az NKÖM támogatásával kezdődött meg újra. A »Mindennapi tudás« rovatot Barát József szerkeszti. Az »Aktuális« rovatot Bán László, Egyed László, Elek László, Gimes Júlia, Lukácsi Béla, Sipos Júlia és Varga Anna gondozza. A nyitóoldalak és a címdokumentumok kialakítása és szerkesztése Pluhár Emese munkája.

A grafikai megjelenítőt és a keresőszoftvert a WiW készítette és fejleszti. A Magyar Virtuális Enciklopédia logoját az Art1st Design Stúdió tervezte.

A Magyar Virtuális Enciklopédia projekt informatikai vezetője Ferencz Sándor tudományos munkatárs, filozófiatörténész. A projektet Golden Dániel tu­dományos munkatárs közreműködésével Nyíri Kristóf irányítja.

A Magyar Virtuális Enciklopédia tartalmi súlypontjainak kialakításában vezető szakértőként közreműködött: Almár Iván (csillagászat) – Bacsó Béla (esztétika) – Bálint Csanád (régészet) – Barabási Albert-László (a hálózatok tudománya) – Benedek András (pedagógia) – Enyedi György (humánföldrajz, településföldrajz) – Frank Tibor (anglisztika-amerikanisztika) – Hámori József (neurobiológia) – Horn Péter (agrártudomány) – Horváth Pál (vallástudomány és teológia) – Hunyady György (szociálpszichológia) – Kósa László (néprajz) – Kroó Norbert (szilárdtestfizika, anyagtudomány, optika) – Láng István (környezet- és természetvédelem) – Marosi Ernő (művészettörténet) – Meskó Attila (föld­tu­do­mány) – Nyíri Kristóf (filozófia) – Ormos Mária (egyetemes történelem) – Palló Gábor (tudománytörténet és kémia) – Patkós András (atomfizika) – Pléh Csaba (kognitív pszichológia) – Romics László (nem-műtéti orvostudomány) – Romsics Ignác (magyar történelem) – Sajó András (jogtudomány) – Simonovits Miklós (matematika) – Szegedy-Maszák Mihály (irodalomtudomány) - Szegő Károly (makrofizika) – Tolcsvai Nagy Gábor (nyelvtudomány) – Török Ádám (Európai Uniós tanulmányok) – Venetianer Pál (molekuláris biológia) – Vizi E. Szilveszter (elméleti orvostudomány) – Wessely Anna (szociológia).